Quelques aspects de microbiologie vus par un physicien : du génome aux communauté bactériennes.

 

 

résumé :

Les bactéries sont des organismes unicellulaires qui ont longtemps été utilisées comme système modèle en biologie.

Malgré leur apparente simplicité ces organismes offrent encore un paysage scientifique en pleine évolution et permettent d’aborder de nombreuses questions à de multiples échelles.

A partir d’exemples de travaux en cours au laboratoire j’illustrerai quelques aspects de l’approche de problématiques de microbiologie par des physiciens.

A l’échelle du génome il s’agira en particulier de travaux d’analyse statistique de la structure codante des génomes bactériens (présence de codons STOP en dehors du cadre de lecture).

A l’échelle de la bactérie unique je montrerai comment des outils de microfluidique permettent de visualiser les mutations et de suivre leurs effets sur plusieurs générations.

Enfin j’aborderai la description de communautés bactériennes formant des biofilms.